2008年起，该公司开始申请国家“核高基”项目，并获得综合测评第一名。如项目落定，公司将获得国家6000万资金投入，加上地方配套，所获得的资助将超过1.8亿元。记者了解到，“核高基”是国家“核心电子器件、高端通用芯片及基础软件产品”重大科技专项的简称，是2006年国务院《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》中与大型飞机、载人航天和探月工程并列的16个重大科技专项之一。

　　重组后永中科技陷破产

　　有核高基专家告诉记者，尽管永中科技经营困难，如果能够获得国家“核高基”项目的资助，加上地方政府的配套，企业也能够走出困境。但2010年，申请“核高基”资助的永中科技突然变成了永中软件有限公司。两者的区别是，永中软件是永中科技投入1万元与华软投资无锡合伙企业投资2500万元建立的新公司，永中科技将所有持有的知识产权特许给永中软件使用，获得1251万元的股权。

　　一位不愿意透露姓名的专家表示，从公司的角度，用于国家“核高基”专项测评产品的知识产权所有权人是“永中科技”，虽然永中软件与永中科技是同一班子人员，但由于有华软投入2500万元注册成立一个完整的公司在先，永中科技的知识产权无偿注入在后，应被视为两家不同的企业。因此，永中软件顶着“永中集成Office”的名义去申请“核高基”，属于冒名顶替。

　　一位已经退职的科技部官员对《每日经济新闻》表示，永中集成Office是由国家财政巨资投入，由永中科技研发的重大科技专项，其知识产权所有权和收益应由永中科技和国家一同分享，而目前由永中科技大股东所主导的重组，将其知识产权注入一家由第三人组建的同名公司，可能已经造成了源代码泄露和国家重大科技专项的自主知识产权流失。

　　对于此次重组，身兼永中科技和永中软件董事长的无锡新区主任助理方存好认为是公司陷入绝境后的自救行为。但曹参认为，将永中科技的股东无锡新区和外资方所有投资及国家研发投入的成果永中集成Office，交换成为1251万元股权的重组，属于清洗国有资产和外资的行为，而永中科技此前欠下的4000余万元债务现也无人问津。

　　重组的原因被解释为深陷经济困境。方存好表示，永中科技创立以来一直没有经营好，靠国家资助过日子。无锡新区管委会主任嵇克检也告诉记者，“7年的实践证明曹参不能把永中带向成功。”

　　方存好给《每日经济新闻》记者发来的书面说明显示，永中科技在2009年下半年有好几个月没有发工资，员工大量流失。曹参提供的数据则显示，截至2009年9月，永中科技新的经营团队的销售量，刚刚超过200万元，曹认为是方存好对市场的不了解直接导致了永中科技的资金困难。

　　2009年10月27日，永中科技举行了临时董事会决议，决定“是否同意由永中象征性出资(如1万元)与中方(或第三方)资本联合组建一个新的公司，由新公司全面接受员工团队、并负责发放10月及后续薪资、维持公司稳定。作为条件之一，永中同意授予新公司现有知识产权的使用权……”。方存好等3名中方股东投了赞成票，而曹参等两名外方股东投了反对票。

　　无锡市工商局的档案显示，2009年11月27日，无锡永中软件有限公司设立，该公司注册资金2501万元，由永中科技出资1万元，占股0.04%，华软投资出资2500万元，占股99.96%。同年12月22日，永中科技的50项专利39项著作权被无偿授权给永中软件使用。2010年1月7日，华软投资赠送50.96%的股份给永中科技使后者股份占比达51%。在董事会成员安排上，曹参和原永中科技的外方股东被彻底排除在外。

　　但这项变更没有挽救永中科技，2010年12月7日，永中科技因未能及时清偿房租、物业费和水电费，且资不抵债，被无锡科创告上法院，要求对该公司进行破产清算。无锡市中级人民法院法官彭国顺告诉记者，将在召开债权人会议后决定永中科技的命运。